ניתוח רצפים גנטיים של נוגדנים ("ביג דאטה").

Big data analysis of antibody DNA sequences

תיאור הפרויקט:

תאי דם לבנים מסוג B מייצרים את הנוגדנים הקיימים בגוף ומהווים את הבסיס ליכולת הזכרון וההסתגלות של מערכת החיסון. הבנה של דינמיקת רפרטואר הנוגדנים בגוף יכולה לסלול דרך לחידושים טכנולוגיים בתחומי הביוטכנולוגיה, פיתוח חיסונים ורפואה מותאמת אישית.
במסגרת פרויקט זה יפותחו כלים סטטיסטיים וחישוביים לטיפול ברצפים גנטים של נוגדנים. בפרט, ייבחנו אלגוריתמים שונים לקלסטריזציה של רפרטואר רצפי הנוגדנים ויצירת עצים גנטיים של נוגדנים אלה.
הפרויקט בעל אופי מחקרי ויכול להתאים לסטודנטים המעונינים להמשיך בכוון זה לתואר מתקדם.
http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n2/full/nbt.2782.html http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2012/05/25/nar.gks457.abstr… http://journal.frontiersin.org/Journal/10.3389/fimmu.2013.00358/abstract  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24618469

תכולת הפרויקט:

כתיבת תוכנות לניתוח רצפים גנטים וניתוח "ביג דאטה"

דרישות:

זיקה לתכנות, סקרנות ומוטיבציה

מקורות:

http://www.nature.com/nbt/journal/v32/n2/full/nbt.2782.html http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2012/05/25/nar.gks457.abstr… http://journal.frontiersin.org/Journal/10.3389/fimmu.2013.00358/abstract  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24618469

דוא"ל: gur.yaari@biu.ac.il